Inicia sus estudios musicales con el profesor Luis E Castro el cual fue su maestro y guía durante toda su carrera musical, además de ser su discípulo preferido.

Juan Castillo es graduado del Plan Juvenil y de la Universidad Nacional de Panamá de Oboísta y Licenciado en Humanidades con especialización en música y el Oboe es su instrumento principal.

Ha recibido clases maestras de oboístas de gran renombre tales como Roger Fedeleck, Dorothy Darlington, Ernest Harrinson, David Busch y por último, ha participado en clases maestras dictadas por el maestro Alex Klein.

En la actualidad el profesor Castillo se desempeña como Oboísta principal de la Orquesta Sinfónica Nacional de Panamá, Profesor titular de oboe en el Instituto Nacional de Música , Oboísta del Grupo de Cámara de la Vicerrectoria de Extensión de la Universidad de Panamá, Fundador y director del grupo de vientos maderas ANJULIS, Fundador y director del grupo de cámara de Dobles Cañas Decarissimo.

Actualmente es uno de los nervios motor preocupado por la evolución musical del país organizando eventos en pro de la juventud musical entre los cuales podemos mencionar la organización de los ya reconocidos internacionalmente Festivales de Dobles Cañas de Centroamérica, México, El Caribe Y Panamá al cual asisten estudiantes y profesores de toda el área Latinoamericana inclusive Estados Unidos y Europa.

En su etapa Juvenil a participado con la Orquesta Sinfónica Juvenil de Costa Rica y la Orquesta Juvenil Centro Americana.

Entre las instituciones o agrupaciones musicales a la que a pertenecido, podemos mencionar: Fundador y miembro de la Orquesta Filarmonía (1976-1980), Banda Republicana (1980-1990), Grupo de Camara Clarinón (1986-1992), Director de la Escuela Juvenil de Música (1997-2000), Banda Sinfónica Municipal (1992-1997), Instructor de la Banda de Conciertos de la Vicerrectoria de Asuntos Estudiantiles de la Universidad de Panamá (1996-2008), Fundador y Director del Trío de Oboes de la Vicerrectoria de Asuntos Estudiantiles de la Universidad de Panamá (2006-2009).

En su trayectoria como solista a nivel nacional e internacional, se ha presentado como tal con la Orquesta Sinfónica Nacional de Panamá, con la Orquesta Sinfónica del Estado de Zulia en Venezuela, Orquesta Sinfónica de El Salvador, Banda 79 del ejercito de los Estados Unidos, La orquesta Sinfónica de Nicaragua, Banda Republicana de Panamá, Banda Municipal de Panamá, Orquesta de Cámara de la Universidad de Panamá, Orquesta Sinfónica de la Universidad de Panamá.

Con el grupo de Cámara Clarinon viajó a Méjico a participar en el Festival Internacional Cervantino, actuando como solista en el mencionado grupo panameño en once estado de Méjico, ganando grandes elogios del público, radio, televisión y prensa escrita, dejando el nombre de Panamá en un alto nivel.

El oboe ejecutado por Juan castillo fue el instrumento estelar sin menospreciar el resto del grupo Periódico el Norte en México.
Además la música de este concierto fue escogida como tema musical representativo de Panamá en los quinientos años del descubrimiento de América, por los organizadores europeos y americanos de este evento.

Ha estrenado diversas obras para oboe, destacándose la primera audición en Panamá y de manera oficial en Latinoamérica del concierto para Oboe y Orquesta de Antonio Pasculli y su actuación junto al renombrado oboísta inglés Malcolm Messiter.

El Profesor Juan Castillo ha dictado clases maestras en la Universidad de Costa Rica y la Universidad de Nicaragua.